Esquema de diseño y solución de la cadena de péptidos de polipéptidos

I. Resumen
Los péptidos son macromoléculas especiales, de modo que sus secuencias son inusuales en sus características químicas y físicas. Algunos péptidos son difíciles de sintetizar, mientras que otros son relativamente fáciles de sintetizar pero difíciles de purificar. El problema práctico es que la mayoría de los péptidos son ligeramente solubles en las soluciones acuosas, por lo que en nuestra purificación, la parte correspondiente del péptido hidrófobo debe disolverse en solventes no acuosos, por lo tanto, estos solventes o tampones pueden ser severamente inconsistentes con el uso de procedimientos experimentales biológicos, por lo que los técnicos están estrictamente prohíbe el uso de su péptido por el uso de sus propios por el propósito de sus propios. del diseño de péptidos para investigadores.

Esquema de diseño y solución de la cadena de péptidos de polipéptidos
Segundo, la elección correcta de péptidos sintéticos difíciles
1. Longitud total de secuencias reguladas a la baja
Los péptidos de menos de 15 residuos son más fáciles de obtener porque el tamaño del péptido aumenta y la pureza del producto crudo disminuye. A medida que la longitud total de la cadena de péptidos aumenta más allá de 20 residuos, la cantidad precisa del producto es una preocupación clave. En muchos experimentos, es fácil obtener efectos inesperados al reducir el número de residuos por debajo de 20.
2. Disminución del número de residuos hidrofóbicos
Los péptidos con un gran predominio de residuos hidrofóbicos, especialmente en los residuos de la Región 7-12 del extremo C, generalmente causan dificultades sintéticas. Esto se ve como una combinación inadecuada precisamente porque se obtiene una hoja B-Fold en la síntesis. "En tales casos, puede ser útil convertir más de dos residuos positivos y negativos, o poner a Gly o Pro en el péptido para desbloquear la composición del péptido".
3. Regulación negativa de residuos "difíciles"
"Hay una serie de residuos Cys, Met, Arg y prueba que generalmente no se sintetizan fácilmente". SER típicamente se usará como una alternativa no oxidativa a los CYS.
Esquema de diseño y solución de la cadena de péptidos de polipéptidos

Tercero, mejorar la elección correcta de soluble en el agua
1. Ajuste el terminal N o C
En relación con los péptidos ácidos (es decir, cargado negativamente a pH 7), la acetilación (acetilación N-terminal, el terminal C siempre mantiene un grupo carboxilo libre) se recomienda particularmente para aumentar la carga negativa. Sin embargo, para los péptidos básicos (es decir, cargado positivamente a pH 7), se recomienda particularmente la aminación (grupo amino libre en el extremo N y la aminación en el extremo C) para aumentar la carga positiva.

2. Acortar o alargar enormemente la secuencia

Algunas de las secuencias contienen una gran cantidad de aminoácidos hidrofóbicos, como TRP, Phe, Val, Ile, Leu, Met, Tyr y Ala, etc. Cuando estos residuos hidrofóbicos exceden el 50%, generalmente no son fáciles de disolver. Puede ser útil alargar la secuencia para aumentar aún más los polos positivos y negativos del péptido. La segunda opción es regular negativamente el tamaño de la cadena de péptidos para aumentar los polos positivos y negativos regulando negativamente los residuos hidrofóbicos. Cuanto más fuertes son los lados positivos y negativos de la cadena de péptidos, más probabilidades tendrá de reaccionar con el agua.
3. Pon en un residuo soluble en agua
Para algunas cadenas de péptidos, la combinación de algunos aminoácidos positivos y negativos puede mejorar la solubilidad de agua. Nuestra compañía recomienda que el extremo N o el extremo C de los péptidos ácidos se combine con Glu-Glu. Se administró el término N o C del péptido básico y luego Lys-lys. Si el grupo cargado no se puede colocar, el ser-Gly-ser también se puede colocar en el término N o C. Sin embargo, este enfoque no funciona cuando los lados de la cadena de péptidos no se pueden cambiar.