Los péptidos penetrantes celulares son péptidos pequeños que pueden penetrar fácilmente en la membrana celular. Esta clase de moléculas, especialmente CPP con funciones de orientación, es prometedora para una administración eficiente de fármacos para las células objetivo.
Por lo tanto, la investigación al respecto tiene cierta importancia biomédica. En este estudio, los CPP con diferentes actividades transmembrana se estudiaron a nivel de secuencia, tratando de descubrir los factores que afectan la actividad transmembrana de los CPP, las diferencias de secuencia entre CPP con diferentes actividades y no CPP, e introducir un método para analizar secuencias biológicas.
Se obtuvieron secuencias de CPPS y NonCPPS de la base de datos CPPSITE y diferentes literaturas, y los péptidos transmembrana (HCPPS, MCPPS, LCPP) con actividad transmembrana alta, media y baja se extrajeron de las secuencias CPPS para construir conjuntos de datos. Según estos conjuntos de datos, se realizaron los siguientes estudios:
1, ANOVA analizó la composición de aminoácidos y estructura secundaria de diferentes CPP activos y no CPP. Se encontró que las interacciones electrostáticas e hidrofóbicas de los aminoácidos jugaron un papel importante en la actividad transmembrana de los CPP, y la estructura helicoidal y el enrollamiento aleatorio también afectaron la actividad transmembrana de los CPP.
2. Las propiedades y longitudes físicas y químicas de los CPP con diferentes actividades se mostraron en el plano bidimensional. Se descubrió que los CPP y los no CPP con diferentes actividades podrían agruparse bajo algunas propiedades especiales, y los HCPP, MCPPS, LCPPS y NONCPPS se dividieron en tres grupos, mostrando sus diferencias;
3. En este artículo, se introduce el concepto de centroide físico y químico de la secuencia biológica, y los residuos que componen la secuencia se consideran como puntos de partículas, y la secuencia se abstrae como un sistema de partículas para la investigación. Este método se aplicó al análisis de CPP al proyectar CPP con diferentes actividades en el plano 3D mediante el método PCA, y se descubrió que la mayoría de los CPP se agruparon y algunos LCPP se agruparon con NonCPP.
Este estudio tiene implicaciones para el diseño de CPP y comprender las diferencias en las secuencias de CPP con diferentes actividades. Además, el método de análisis del centroide físico y químico de las secuencias biológicas introducidas en este documento también se puede utilizar para el análisis de otros problemas biológicos. Al mismo tiempo, se pueden usar como parámetros de entrada para algunos problemas de clasificación biológica y juegan un papel en el reconocimiento de patrones.
Tiempo de publicación: 2025-07-02