¿Qué son los péptidos que penetran las células?

Los péptidos que penetran las células son pequeños péptidos que pueden penetrar fácilmente la membrana celular.Esta clase de moléculas, especialmente las CPP con funciones de dirección, son prometedoras para la administración eficaz de fármacos a las células diana.

Por tanto, la investigación al respecto tiene cierta importancia biomédica.En este estudio, se estudiaron CPP con diferentes actividades transmembrana a nivel de secuencia, tratando de descubrir los factores que afectan la actividad transmembrana de CPP, las diferencias de secuencia entre CPP con diferentes actividades y NonCPP, e introducir un método para analizar secuencias biológicas.

Las secuencias de CPP y NonCPP se obtuvieron de la base de datos de CPPsite y de diferentes literaturas, y los péptidos transmembrana (HCPP, MCPP, LCPP) con actividad transmembrana alta, media y baja se extrajeron de las secuencias de CPP para construir conjuntos de datos.Con base en estos conjuntos de datos, se realizaron los siguientes estudios:

1. La composición de aminoácidos y la estructura secundaria de diferentes CPP y NonCPP activos se analizaron mediante ANOVA.Se descubrió que las interacciones electrostáticas e hidrofóbicas de los aminoácidos desempeñaban un papel importante en la actividad transmembrana de los CPP, y que la estructura helicoidal y el enrollamiento aleatorio también afectaban la actividad transmembrana de los CPP.

2. Las propiedades físicas y químicas y las longitudes de los CPP con diferentes actividades se mostraron en un plano bidimensional.Se encontró que los CPP y NonCPP con diferentes actividades podían agruparse bajo algunas propiedades especiales, y los HCPP, MCPP, LCPP y NonCPP se dividieron en tres grupos, mostrando sus diferencias;

3. En este artículo, se introduce el concepto de centroide físico y químico de una secuencia biológica, y los residuos que componen la secuencia se consideran puntos de partículas, y la secuencia se abstrae como un sistema de partículas para la investigación.Este método se aplicó al análisis de CPP proyectando CPP con diferentes actividades en el plano 3D mediante el método PCA, y se encontró que la mayoría de los CPP se agrupaban y algunos LCPP se agrupaban con NonCPP.

Este estudio tiene implicaciones para el diseño de CPP y la comprensión de las diferencias en las secuencias de CPP con diferentes actividades.Además, el método de análisis del centroide físico y químico de secuencias biológicas presentado en este artículo también se puede utilizar para el análisis de otros problemas biológicos.Al mismo tiempo, pueden usarse como parámetros de entrada para algunos problemas de clasificación biológica y desempeñar un papel en el reconocimiento de patrones.