Los dipéptidos pseudo-prolina contienen oxazoles formados a partir de serina o treonina. Cuando se tratan con ácido trifluoroacético (TFA), los oxazoles se convierten en serina o treonina. Los oxazoles tienen similitud estructural con la prolina y, por lo tanto, se denominan pseudo-prolina. Al igual que la prolina, la pseudo-prolina forma una "torcedura" en la columna vertebral de poliamida del péptido. Esta torcedura interrumpe los enlaces de hidrógeno interchain responsables de la agregación. La incorporación de pseudo-prolina en la secuencia de péptidos mejora la eficiencia del acoplamiento, mejorando así la pureza y el rendimiento del péptido. El acoplamiento con pseudo-prolina es difícil y el rendimiento del acoplamiento suele ser bajo. Por lo tanto, la pseudo-prolina se usa como un dipéptido pseudo-prolina preformado en la síntesis de péptidos.
La pseudoprolina es estable en condiciones débilmente ácidas. Los péptidos que contienen pseudoprolina se pueden preparar en resina 2-clorotrityl o resina Sieber y se escinden en presencia de pseudoprolina.
En comparación con los péptidos estándar correspondientes, los péptidos que contienen pseudo-prolina tienen una mejor solubilidad. Esto hace que los péptidos que contienen pseudo-prolina sean más fáciles de purificar y usar en reacciones de condensación de fragmentos. Además, los péptidos con pseudo-prolina en el extremo C se pueden acoplar sin racemización del residuo C-terminal.
El nudo causado por pseudo-prolina en péptidos lineales ayuda a formar péptidos cíclicos. Se ha informado que la adición de pseudo-prolina puede aumentar el rendimiento de péptidos cíclicos y acelerar la reacción de ciclación.
La pseudo-prolina interrumpe los enlaces de hidrógeno en la columna vertebral del péptido.
La pseudo-prolina interrumpe los enlaces de hidrógeno entre las cadenas de péptidos.
La pseudo-prolina bloquea la formación de subproductos de asparagina y los producidos por la formación de asparagina. Se usa en la semi-síntesis de la subunidad R2 de Escherichia coli ribonucleótido reductasa. Este método también se ha aplicado recientemente a la síntesis del dominio glucopéptido de la eritropoyetina.
Directrices para el uso de dipéptido de pseudoprolina
Si es posible, inserte una pseudo-prolina antes de la región hidrofóbica.
Debe haber al menos dos aminoácidos entre los residuos de pseudo-prolina o entre pseudo-prolina y prolina.
El espaciado óptimo es de 5 a 6 aminoácidos entre pseudo-prolinas o entre un pseudo-prolina y una prolina.
Tiempo de publicación: 2025-08-13