Esquema de diseño y solución de cadena peptídica polipeptídica.

I. Resumen
Los péptidos son macromoléculas especiales cuyas secuencias son inusuales en sus características químicas y físicas.Algunos péptidos son difíciles de sintetizar, mientras que otros son relativamente fáciles de sintetizar pero difíciles de purificar.El problema práctico es que la mayoría de los péptidos son ligeramente solubles en soluciones acuosas, por lo que en nuestra purificación, la parte correspondiente del péptido hidrófobo debe disolverse en disolventes no acuosos. Por lo tanto, es probable que estos disolventes o tampones sean muy incompatibles con el uso. de procedimientos experimentales biológicos, por lo que los técnicos tienen estrictamente prohibido utilizar el péptido para sus propios fines, por lo que a continuación se detallan varios aspectos del diseño de péptidos para investigadores.

Esquema de diseño y solución de cadena peptídica polipeptídica.
En segundo lugar, la elección correcta de péptidos sintéticos difíciles.
1. Longitud total de secuencias reguladas negativamente
Los péptidos de menos de 15 residuos son más fáciles de obtener porque el tamaño del péptido aumenta y la pureza del producto bruto disminuye.A medida que la longitud total de la cadena peptídica aumenta más allá de los 20 residuos, la cantidad precisa del producto es una preocupación clave.En muchos experimentos, es fácil obtener efectos inesperados reduciendo el número de residuos por debajo de 20.
2. Disminuir la cantidad de residuos hidrofóbicos
Los péptidos con un gran predominio de residuos hidrófobos, especialmente en la región de 7 a 12 residuos del extremo C, suelen causar dificultades de síntesis.Esto se considera una combinación inadecuada precisamente porque en la síntesis se obtiene una hoja plegada en B."En tales casos, puede resultar útil convertir más de dos residuos positivos y negativos, o poner Gly o Pro en el péptido para desbloquear la composición peptídica".
3. Regulación a la baja de residuos “difíciles”
"Hay varios residuos Cys, Met, Arg y Try que generalmente no se sintetizan fácilmente".Normalmente, Ser se utilizará como una alternativa no oxidativa a Cys.
Esquema de diseño y solución de cadena peptídica polipeptídica.

En tercer lugar, mejorar la elección correcta de soluble en agua.
1. Ajuste el terminal N o C
En relación con los péptidos ácidos (es decir, cargados negativamente a pH 7), se recomienda especialmente la acetilación (acetilación del extremo N, el extremo C siempre mantiene un grupo carboxilo libre) para aumentar la carga negativa.Sin embargo, para los péptidos básicos (es decir, cargados positivamente a pH 7), se recomienda particularmente la aminación (grupo amino libre en el extremo N y aminación en el extremo C) para aumentar la carga positiva.

2. Acortar o alargar mucho la secuencia.

Algunas de las secuencias contienen una gran cantidad de aminoácidos hidrofóbicos, como Trp, Phe, Val, Ile, Leu, Met, Tyr y Ala, etc. Cuando estos residuos hidrofóbicos superan el 50%, normalmente no son fáciles de disolver.Puede resultar útil alargar la secuencia para aumentar aún más los polos positivo y negativo del péptido.La segunda opción es regular a la baja el tamaño de la cadena peptídica para aumentar los polos positivo y negativo mediante la regulación a la baja de los residuos hidrofóbicos.Cuanto más fuertes sean los lados positivo y negativo de la cadena peptídica, es más probable que reaccione con el agua.
3. Poner un residuo soluble en agua.
Para algunas cadenas peptídicas, la combinación de algunos aminoácidos positivos y negativos puede mejorar la solubilidad en agua.Nuestra empresa recomienda combinar el extremo N o C de los péptidos ácidos con Glu-Glu.Se proporcionó el extremo N o C del péptido básico y luego Lys-Lys.Si no se puede colocar el grupo cargado, Ser-Gly-Ser también se puede colocar en el extremo N o C.Sin embargo, este enfoque no funciona cuando los lados de la cadena peptídica no se pueden cambiar.