En la superficie, la formación de enlaces peptídicos, que dan lugar a dipéptidos, es un proceso químico simple.Esto significa que los dos componentes de aminoácidos están unidos por un enlace peptídico, un enlace amida, mientras están deshidratados.
La formación de enlaces peptídicos es la activación de un aminoácido en condiciones de reacción suaves.(A) resto carboxilo, segundo aminoácido (B) El resto carboxilo activado nucleófilo forma entonces el dipéptido (AB)."Si el componente carboxilo (A) no está protegido, no se puede controlar la formación del enlace peptídico".Se pueden mezclar subproductos tales como péptidos lineales y cíclicos con los compuestos diana AB.Por lo tanto, todos los grupos funcionales que no participan en la formación de enlaces peptídicos deben protegerse de manera temporalmente reversible durante la síntesis de péptidos.
Entonces, la síntesis de péptidos (la formación de cada enlace peptídico) implica tres pasos de agregación.
El primer paso es preparar algunos aminoácidos que necesitan protección y la estructura zwitteriónica de los aminoácidos ya no existe.
El segundo paso es una reacción de dos pasos para formar enlaces peptídicos, en la que primero se activa el grupo carboxilo del aminoácido N-protegido al intermedio activo y luego se forma el enlace peptídico.Esta reacción acoplada puede ocurrir como una reacción de un solo paso o como dos reacciones secuenciales.
El tercer paso es la eliminación selectiva o eliminación completa de la base protectora.Aunque toda la eliminación sólo puede ocurrir después de que se hayan ensamblado todas las cadenas peptídicas, también se requiere la eliminación selectiva de los grupos protectores para continuar con la síntesis de péptidos.
Porque 10 aminoácidos (Ser, Thr, Tyr, Asp, Glu, Lys, Arg, His, Sec y Cys) contienen grupos funcionales de cadenas laterales, que requieren protección selectiva, lo que complica la síntesis de péptidos.Las bases de protección temporal y semipermanente deben distinguirse debido a los diferentes requisitos de selectividad.Los grupos de protección temporal se utilizan en el siguiente paso para reflejar la protección temporal de los grupos funcionales aminoácido o carboxilo.Los grupos protectores semipermanentes se eliminan sin interferir con los enlaces peptídicos o las cadenas laterales de aminoácidos ya formados, a veces durante la síntesis.
"Idealmente, la activación del componente carboxilo y la posterior formación de enlaces peptídicos (reacciones de acoplamiento) deberían ser rápidas, sin formación racémica o de subproductos, y deberían aplicarse reactivos molares para lograr altos rendimientos".Desafortunadamente, ninguno de los métodos de acoplamiento químico satisface estos requisitos y pocos son adecuados para la síntesis práctica.
Durante la síntesis de péptidos, los grupos funcionales implicados en diversas reacciones suelen estar vinculados al centro manual, siendo la glicina la única excepción, y existe un riesgo potencial de rotación.
El último paso en el ciclo de síntesis de péptidos es la eliminación de todos los grupos protectores.La eliminación selectiva de grupos protectores es importante para la extensión de la cadena peptídica, además del requisito de eliminación completa de la protección en la síntesis de dipéptidos.Las estrategias sintéticas deben planificarse cuidadosamente.Dependiendo de la elección estratégica, el N puede eliminar selectivamente los grupos protectores α-amino o carboxilo.El término "estrategia" se refiere a la secuencia de reacciones de condensación de aminoácidos individuales.En general, existe una diferencia entre síntesis gradual y condensación de fragmentos.La síntesis de péptidos (también conocida como “síntesis convencional”) tiene lugar en solución.En la mayoría de los casos, el alargamiento gradual de la cadena peptídica sólo puede sintetizarse utilizando la cadena peptídica para sintetizar fragmentos más cortos.Para sintetizar péptidos más largos, las moléculas objetivo deben segmentarse en fragmentos apropiados y determinarse que pueden minimizar el grado de diferenciación en el extremo C.Después de que los fragmentos individuales se ensamblan gradualmente, se unirá el compuesto objetivo.La estrategia de síntesis de péptidos incluye la selección del mejor y más apropiado fragmento protector, y la estrategia de síntesis de péptidos incluye la selección de la combinación más apropiada de bases protectoras y el mejor método de conjugación de fragmentos.
Hora de publicación: 19-jul-2023